Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBE8

Wdr18, WD repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr18Q4VBE8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr18Q4VBE8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr18Q4VBE8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr18Q4VBE8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr18Q4VBE8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr18Q4VBE8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr18Q4VBE8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms