Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBD2

Tapt1, Transmembrane anterior posterior transformation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tapt1Q4VBD2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tapt1Q4VBD2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms