Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms