Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srek1ip1Q4V9W2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms