Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syne3Q4FZC9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syne3Q4FZC9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms