Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt35Q497I4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms