Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G9

1810049J17Rik, RIKEN cDNA 1810049J17 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810049J17RikQ3V2G9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1810049J17RikQ3V2G9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
1810049J17RikQ3V2G9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
1810049J17RikQ3V2G9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
1810049J17RikQ3V2G9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
1810049J17RikQ3V2G9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms