Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms