Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b4Q3V0X2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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