Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm5aQ3UXZ9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms