Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim40Q3UWA4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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