Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate2Q3UW31 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms