Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slfn4Q3UV66 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms