Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thsd4Q3UTY6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thsd4Q3UTY6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms