Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Znf48Q3US17 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Znf48Q3US17 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Znf48Q3US17 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Znf48Q3US17 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Znf48Q3US17 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Znf48Q3US17 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Znf48Q3US17 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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