Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Acsf3Q3URE1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Acsf3Q3URE1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms