Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UPC7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UPC7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UPC7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UPC7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UPC7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UPC7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UPC7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UPC7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UPC7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UPC7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UPC7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UPC7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q3UPC7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UPC7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UPC7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UPC7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UPC7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UPC7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UPC7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UPC7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UPC7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UPC7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3UPC7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms