Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrch2Q3UMG5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms