Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cog7Q3UM29 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms