Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms