Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms