Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smu1Q3UKJ7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms