Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sf3b2Q3UJB0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms