Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms