Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms