Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mier3Q3UHF3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mier3Q3UHF3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms