Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms