Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll12Q3UDE2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll12Q3UDE2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms