Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pid1Q3UBG2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pid1Q3UBG2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pid1Q3UBG2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pid1Q3UBG2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pid1Q3UBG2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pid1Q3UBG2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pid1Q3UBG2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pid1Q3UBG2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pid1Q3UBG2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pid1Q3UBG2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pid1Q3UBG2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pid1Q3UBG2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pid1Q3UBG2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pid1Q3UBG2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms