Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf2Q3UAW9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brf2Q3UAW9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms