Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LbrQ3U9G9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LbrQ3U9G9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms