Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cops9Q3U898 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms