Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud5Q3U2S4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
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Otud5Q3U2S4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Otud5Q3U2S4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms