Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U1D9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U1D9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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