Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem35bQ3U0Y2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms