Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd6Q3TY92 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd6Q3TY92 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms