Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc28Q3TX51 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms