Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms