Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUL7

Dcaf17, DDB1- and CUL4-associated factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf17Q3TUL7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dcaf17Q3TUL7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dcaf17Q3TUL7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms