Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTL0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTL0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3TTL0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms