Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q3TTJ4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms