Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh5Q3TSG4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms