Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fubp3Q3TIX6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fubp3Q3TIX6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms