Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afvQ3THW5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms