Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc69Q3TCJ8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms