Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem248Q3TBN1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms