Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prr27Q3SYJ2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prr27Q3SYJ2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prr27Q3SYJ2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms