Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms