Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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