Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpm1Q2TV84 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm1Q2TV84 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms